Es un error muy normal al actualizar a wordpress 3.4.1 incluso al instalarlo de nuevo que se nos muestre el error PHP Fatal error: Call to undefined function get_option() in path/wp-admin/admin.php on line 32

En algunos casos (los menos) el error es producido porque la actualización deja algunos ficheros del raiz de wordpress con 0 KB.
Simplemente habrá que volverlos a subir manualmente y solucionado.

En el caso mas normal, este error viene causado por la configuración de la extensión de PHP APC.
Para solucionarlo simplemente tendremos que modificar el parametro apc.include_once_override = 0.

Para esto buscaremos el fichero apc.ini (en ubuntu suele estar en /etc/php5/conf.d/apc.ini) y lo modifaremos incluyendo apc.include_once_override = 0
Una vez modificado habrá que reiniciar Apache (en ubuntu sudo /etc/init.d/apache2 restart )